Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRR29P0C7W0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRR29P0C7W0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRR29P0C7W0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRR29P0C7W0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRR29P0C7W0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRR29P0C7W0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRR29P0C7W0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR29P0C7W0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR29P0C7W0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR29P0C7W0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms