Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
POLA1P09884 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
POLA1P09884 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
POLA1P09884 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
POLA1P09884 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
POLA1P09884 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
POLA1P09884 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
POLA1P09884 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
POLA1P09884 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
POLA1P09884 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
POLA1P09884 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
POLA1P09884 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
POLA1P09884 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
POLA1P09884 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
POLA1P09884 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
POLA1P09884 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
POLA1P09884 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
POLA1P09884 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
POLA1P09884 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
POLA1P09884 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
POLA1P09884 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
POLA1P09884 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.02
POLA1P09884 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
POLA1P09884 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
POLA1P09884 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
POLA1P09884 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
POLA1P09884 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
POLA1P09884 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
POLA1P09884 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
POLA1P09884 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
POLA1P09884 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
POLA1P09884 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
POLA1P09884 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
POLA1P09884 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
POLA1P09884 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
POLA1P09884 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC40.07■■■■■ 4
POLA1P09884 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
POLA1P09884 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
POLA1P09884 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC40.06■■■■■ 4
POLA1P09884 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
POLA1P09884 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
POLA1P09884 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC40.06■■■■■ 4
POLA1P09884 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
POLA1P09884 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
POLA1P09884 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
POLA1P09884 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
POLA1P09884 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
POLA1P09884 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
POLA1P09884 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
POLA1P09884 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
POLA1P09884 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
POLA1P09884 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
POLA1P09884 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
POLA1P09884 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.03■■■■■ 4
POLA1P09884 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC40.03■■■■■ 4
POLA1P09884 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
POLA1P09884 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
POLA1P09884 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
POLA1P09884 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
POLA1P09884 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
POLA1P09884 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
POLA1P09884 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
POLA1P09884 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
POLA1P09884 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
POLA1P09884 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
POLA1P09884 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
POLA1P09884 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC40■■■■□ 3.99
POLA1P09884 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
POLA1P09884 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
POLA1P09884 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC40■■■■□ 3.99
POLA1P09884 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
POLA1P09884 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
POLA1P09884 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
POLA1P09884 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
POLA1P09884 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
POLA1P09884 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
POLA1P09884 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
POLA1P09884 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
POLA1P09884 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
POLA1P09884 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
POLA1P09884 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
POLA1P09884 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
POLA1P09884 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
POLA1P09884 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
POLA1P09884 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
POLA1P09884 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
POLA1P09884 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
POLA1P09884 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
POLA1P09884 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
POLA1P09884 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
POLA1P09884 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
POLA1P09884 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
POLA1P09884 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
POLA1P09884 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
POLA1P09884 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
POLA1P09884 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
POLA1P09884 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC39.92■■■■□ 3.98
POLA1P09884 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
POLA1P09884 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
POLA1P09884 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms