Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTAP09496 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTAP09496 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTAP09496 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTAP09496 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTAP09496 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTAP09496 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTAP09496 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTAP09496 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTAP09496 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTAP09496 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTAP09496 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTAP09496 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTAP09496 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTAP09496 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTAP09496 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTAP09496 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTAP09496 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTAP09496 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CLTAP09496 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTAP09496 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTAP09496 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTAP09496 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTAP09496 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTAP09496 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTAP09496 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTAP09496 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTAP09496 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTAP09496 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTAP09496 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTAP09496 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTAP09496 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTAP09496 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTAP09496 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTAP09496 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTAP09496 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTAP09496 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTAP09496 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTAP09496 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTAP09496 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTAP09496 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTAP09496 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTAP09496 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTAP09496 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTAP09496 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTAP09496 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTAP09496 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTAP09496 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTAP09496 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTAP09496 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTAP09496 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTAP09496 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTAP09496 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTAP09496 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTAP09496 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTAP09496 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTAP09496 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTAP09496 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTAP09496 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTAP09496 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTAP09496 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTAP09496 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTAP09496 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTAP09496 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTAP09496 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTAP09496 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTAP09496 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTAP09496 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTAP09496 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTAP09496 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTAP09496 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTAP09496 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTAP09496 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTAP09496 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTAP09496 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTAP09496 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTAP09496 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTAP09496 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLTAP09496 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTAP09496 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTAP09496 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTAP09496 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTAP09496 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLTAP09496 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTAP09496 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTAP09496 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTAP09496 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTAP09496 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTAP09496 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLTAP09496 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTAP09496 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTAP09496 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTAP09496 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTAP09496 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTAP09496 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLTAP09496 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTAP09496 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLTAP09496 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTAP09496 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLTAP09496 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms