Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP1P09455 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP1P09455 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP1P09455 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP1P09455 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP1P09455 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP1P09455 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP1P09455 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP1P09455 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP1P09455 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP1P09455 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP1P09455 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP1P09455 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP1P09455 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP1P09455 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP1P09455 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP1P09455 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP1P09455 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP1P09455 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP1P09455 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP1P09455 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP1P09455 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP1P09455 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP1P09455 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP1P09455 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP1P09455 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP1P09455 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP1P09455 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP1P09455 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP1P09455 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP1P09455 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP1P09455 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP1P09455 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP1P09455 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP1P09455 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP1P09455 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP1P09455 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP1P09455 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP1P09455 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP1P09455 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP1P09455 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP1P09455 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP1P09455 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP1P09455 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP1P09455 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP1P09455 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP1P09455 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP1P09455 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP1P09455 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP1P09455 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP1P09455 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP1P09455 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP1P09455 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBP1P09455 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBP1P09455 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBP1P09455 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP1P09455 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP1P09455 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP1P09455 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP1P09455 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP1P09455 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP1P09455 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP1P09455 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP1P09455 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP1P09455 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP1P09455 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP1P09455 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP1P09455 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP1P09455 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP1P09455 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP1P09455 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP1P09455 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP1P09455 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP1P09455 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP1P09455 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP1P09455 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP1P09455 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP1P09455 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP1P09455 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP1P09455 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP1P09455 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP1P09455 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP1P09455 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP1P09455 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP1P09455 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP1P09455 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP1P09455 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP1P09455 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP1P09455 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP1P09455 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms