Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC4P09017 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC4P09017 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms