Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSBP07858 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSBP07858 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSBP07858 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSBP07858 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSBP07858 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSBP07858 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSBP07858 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSBP07858 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSBP07858 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSBP07858 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSBP07858 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSBP07858 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSBP07858 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSBP07858 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSBP07858 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSBP07858 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSBP07858 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSBP07858 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSBP07858 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSBP07858 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSBP07858 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSBP07858 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSBP07858 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSBP07858 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSBP07858 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSBP07858 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSBP07858 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSBP07858 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSBP07858 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSBP07858 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSBP07858 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSBP07858 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSBP07858 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSBP07858 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSBP07858 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSBP07858 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSBP07858 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSBP07858 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSBP07858 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSBP07858 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSBP07858 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSBP07858 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSBP07858 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSBP07858 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSBP07858 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSBP07858 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSBP07858 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSBP07858 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSBP07858 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSBP07858 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSBP07858 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSBP07858 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSBP07858 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSBP07858 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSBP07858 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTSBP07858 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTSBP07858 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTSBP07858 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTSBP07858 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTSBP07858 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSBP07858 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSBP07858 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSBP07858 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSBP07858 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSBP07858 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSBP07858 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSBP07858 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSBP07858 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSBP07858 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSBP07858 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSBP07858 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSBP07858 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSBP07858 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSBP07858 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSBP07858 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSBP07858 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSBP07858 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSBP07858 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSBP07858 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSBP07858 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSBP07858 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSBP07858 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSBP07858 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSBP07858 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSBP07858 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSBP07858 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSBP07858 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSBP07858 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSBP07858 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSBP07858 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSBP07858 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSBP07858 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSBP07858 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSBP07858 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSBP07858 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSBP07858 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSBP07858 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSBP07858 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSBP07858 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms