Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA4P06727 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA4P06727 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA4P06727 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA4P06727 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA4P06727 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA4P06727 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA4P06727 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA4P06727 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA4P06727 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA4P06727 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA4P06727 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA4P06727 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA4P06727 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA4P06727 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA4P06727 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA4P06727 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA4P06727 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA4P06727 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA4P06727 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA4P06727 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA4P06727 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA4P06727 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA4P06727 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA4P06727 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA4P06727 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA4P06727 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA4P06727 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA4P06727 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA4P06727 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA4P06727 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA4P06727 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA4P06727 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA4P06727 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA4P06727 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA4P06727 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA4P06727 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA4P06727 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA4P06727 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA4P06727 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA4P06727 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA4P06727 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA4P06727 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA4P06727 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA4P06727 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA4P06727 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA4P06727 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA4P06727 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA4P06727 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA4P06727 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA4P06727 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA4P06727 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA4P06727 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA4P06727 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA4P06727 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA4P06727 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA4P06727 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA4P06727 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA4P06727 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA4P06727 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA4P06727 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA4P06727 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA4P06727 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA4P06727 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA4P06727 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA4P06727 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA4P06727 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA4P06727 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA4P06727 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA4P06727 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA4P06727 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA4P06727 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA4P06727 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA4P06727 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA4P06727 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA4P06727 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOA4P06727 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA4P06727 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA4P06727 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA4P06727 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA4P06727 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA4P06727 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA4P06727 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA4P06727 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms