Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RB1P06400 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RB1P06400 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RB1P06400 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RB1P06400 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RB1P06400 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RB1P06400 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RB1P06400 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RB1P06400 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RB1P06400 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RB1P06400 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RB1P06400 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RB1P06400 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RB1P06400 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RB1P06400 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RB1P06400 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RB1P06400 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RB1P06400 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RB1P06400 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RB1P06400 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RB1P06400 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RB1P06400 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RB1P06400 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RB1P06400 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RB1P06400 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RB1P06400 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RB1P06400 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RB1P06400 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RB1P06400 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RB1P06400 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RB1P06400 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RB1P06400 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RB1P06400 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RB1P06400 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RB1P06400 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RB1P06400 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RB1P06400 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RB1P06400 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RB1P06400 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RB1P06400 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RB1P06400 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RB1P06400 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RB1P06400 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RB1P06400 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RB1P06400 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RB1P06400 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RB1P06400 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RB1P06400 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RB1P06400 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RB1P06400 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RB1P06400 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RB1P06400 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RB1P06400 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RB1P06400 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RB1P06400 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RB1P06400 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RB1P06400 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RB1P06400 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RB1P06400 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RB1P06400 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RB1P06400 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RB1P06400 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RB1P06400 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RB1P06400 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RB1P06400 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RB1P06400 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RB1P06400 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RB1P06400 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RB1P06400 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RB1P06400 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RB1P06400 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RB1P06400 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RB1P06400 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RB1P06400 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RB1P06400 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RB1P06400 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RB1P06400 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RB1P06400 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RB1P06400 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RB1P06400 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RB1P06400 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RB1P06400 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RB1P06400 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RB1P06400 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RB1P06400 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RB1P06400 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RB1P06400 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RB1P06400 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RB1P06400 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RB1P06400 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RB1P06400 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RB1P06400 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RB1P06400 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RB1P06400 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RB1P06400 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RB1P06400 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RB1P06400 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RB1P06400 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RB1P06400 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RB1P06400 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms