Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPIND1P05546 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPIND1P05546 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms