Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYMSP04818 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYMSP04818 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYMSP04818 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYMSP04818 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYMSP04818 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYMSP04818 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYMSP04818 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYMSP04818 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYMSP04818 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TYMSP04818 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYMSP04818 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TYMSP04818 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TYMSP04818 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYMSP04818 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYMSP04818 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYMSP04818 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYMSP04818 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYMSP04818 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYMSP04818 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYMSP04818 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TYMSP04818 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYMSP04818 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYMSP04818 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYMSP04818 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYMSP04818 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TYMSP04818 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYMSP04818 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYMSP04818 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYMSP04818 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TYMSP04818 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TYMSP04818 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TYMSP04818 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TYMSP04818 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TYMSP04818 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TYMSP04818 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TYMSP04818 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TYMSP04818 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TYMSP04818 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TYMSP04818 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TYMSP04818 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TYMSP04818 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TYMSP04818 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TYMSP04818 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TYMSP04818 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TYMSP04818 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TYMSP04818 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TYMSP04818 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TYMSP04818 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYMSP04818 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYMSP04818 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYMSP04818 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TYMSP04818 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYMSP04818 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYMSP04818 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms