Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THY1P04216 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THY1P04216 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THY1P04216 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THY1P04216 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THY1P04216 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THY1P04216 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THY1P04216 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THY1P04216 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THY1P04216 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THY1P04216 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THY1P04216 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THY1P04216 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THY1P04216 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THY1P04216 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THY1P04216 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THY1P04216 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
THY1P04216 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THY1P04216 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THY1P04216 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THY1P04216 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THY1P04216 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THY1P04216 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THY1P04216 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THY1P04216 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THY1P04216 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THY1P04216 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THY1P04216 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
THY1P04216 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
THY1P04216 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
THY1P04216 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
THY1P04216 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THY1P04216 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THY1P04216 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THY1P04216 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THY1P04216 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THY1P04216 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
THY1P04216 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THY1P04216 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THY1P04216 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THY1P04216 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THY1P04216 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THY1P04216 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THY1P04216 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THY1P04216 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THY1P04216 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THY1P04216 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THY1P04216 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THY1P04216 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THY1P04216 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THY1P04216 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THY1P04216 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THY1P04216 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THY1P04216 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THY1P04216 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THY1P04216 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
THY1P04216 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THY1P04216 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THY1P04216 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THY1P04216 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THY1P04216 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THY1P04216 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THY1P04216 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THY1P04216 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THY1P04216 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THY1P04216 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THY1P04216 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THY1P04216 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THY1P04216 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THY1P04216 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THY1P04216 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THY1P04216 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THY1P04216 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THY1P04216 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THY1P04216 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THY1P04216 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms