Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC2P02655 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC2P02655 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC2P02655 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC2P02655 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC2P02655 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC2P02655 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC2P02655 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC2P02655 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC2P02655 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC2P02655 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC2P02655 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC2P02655 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC2P02655 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC2P02655 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC2P02655 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC2P02655 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC2P02655 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC2P02655 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC2P02655 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC2P02655 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOC2P02655 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC2P02655 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC2P02655 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC2P02655 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC2P02655 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC2P02655 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC2P02655 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOC2P02655 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOC2P02655 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC2P02655 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC2P02655 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC2P02655 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC2P02655 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC2P02655 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC2P02655 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC2P02655 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC2P02655 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC2P02655 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC2P02655 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC2P02655 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC2P02655 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC2P02655 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC2P02655 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC2P02655 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC2P02655 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC2P02655 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC2P02655 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC2P02655 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC2P02655 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC2P02655 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC2P02655 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC2P02655 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC2P02655 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC2P02655 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC2P02655 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC2P02655 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC2P02655 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC2P02655 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC2P02655 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC2P02655 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC2P02655 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC2P02655 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC2P02655 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC2P02655 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC2P02655 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC2P02655 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC2P02655 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC2P02655 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC2P02655 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC2P02655 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC2P02655 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC2P02655 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC2P02655 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC2P02655 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC2P02655 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC2P02655 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC2P02655 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC2P02655 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC2P02655 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC2P02655 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC2P02655 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC2P02655 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC2P02655 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC2P02655 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC2P02655 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC2P02655 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC2P02655 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms