Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRBC1P01850 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRBC1P01850 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBC1P01850 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms