Protein–RNA interactions for Protein: P01762

IGHV3-11, Immunoglobulin heavy variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-11P01762 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-11P01762 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-11P01762 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGHV3-11P01762 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGHV3-11P01762 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGHV3-11P01762 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGHV3-11P01762 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-11P01762 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms