Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CST3P01034 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CST3P01034 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CST3P01034 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CST3P01034 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CST3P01034 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CST3P01034 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CST3P01034 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CST3P01034 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CST3P01034 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CST3P01034 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CST3P01034 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CST3P01034 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CST3P01034 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CST3P01034 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CST3P01034 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CST3P01034 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CST3P01034 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CST3P01034 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CST3P01034 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CST3P01034 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CST3P01034 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CST3P01034 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CST3P01034 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CST3P01034 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CST3P01034 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CST3P01034 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CST3P01034 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CST3P01034 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CST3P01034 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CST3P01034 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CST3P01034 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CST3P01034 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CST3P01034 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CST3P01034 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CST3P01034 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CST3P01034 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CST3P01034 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CST3P01034 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CST3P01034 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CST3P01034 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CST3P01034 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CST3P01034 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CST3P01034 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CST3P01034 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CST3P01034 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CST3P01034 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CST3P01034 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CST3P01034 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CST3P01034 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CST3P01034 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CST3P01034 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CST3P01034 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CST3P01034 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CST3P01034 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CST3P01034 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CST3P01034 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CST3P01034 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CST3P01034 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CST3P01034 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CST3P01034 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CST3P01034 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CST3P01034 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CST3P01034 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CST3P01034 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CST3P01034 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CST3P01034 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CST3P01034 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CST3P01034 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CST3P01034 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CST3P01034 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CST3P01034 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CST3P01034 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CST3P01034 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CST3P01034 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CST3P01034 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CST3P01034 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CST3P01034 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CST3P01034 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CST3P01034 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CST3P01034 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CST3P01034 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CST3P01034 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CST3P01034 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CST3P01034 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CST3P01034 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CST3P01034 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms