Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD2O96028 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NSD2O96028 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD2O96028 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NSD2O96028 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NSD2O96028 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NSD2O96028 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD2O96028 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD2O96028 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD2O96028 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD2O96028 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD2O96028 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD2O96028 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD2O96028 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD2O96028 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NSD2O96028 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NSD2O96028 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NSD2O96028 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NSD2O96028 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NSD2O96028 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD2O96028 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD2O96028 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD2O96028 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD2O96028 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD2O96028 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NSD2O96028 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NSD2O96028 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NSD2O96028 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NSD2O96028 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NSD2O96028 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD2O96028 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD2O96028 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD2O96028 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD2O96028 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD2O96028 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD2O96028 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD2O96028 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD2O96028 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD2O96028 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NSD2O96028 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NSD2O96028 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NSD2O96028 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NSD2O96028 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NSD2O96028 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NSD2O96028 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NSD2O96028 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NSD2O96028 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD2O96028 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD2O96028 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD2O96028 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD2O96028 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD2O96028 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD2O96028 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD2O96028 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD2O96028 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD2O96028 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD2O96028 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD2O96028 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
NSD2O96028 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
NSD2O96028 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD2O96028 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD2O96028 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD2O96028 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD2O96028 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD2O96028 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD2O96028 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD2O96028 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NSD2O96028 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD2O96028 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD2O96028 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD2O96028 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD2O96028 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD2O96028 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD2O96028 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD2O96028 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NSD2O96028 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NSD2O96028 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NSD2O96028 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NSD2O96028 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NSD2O96028 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NSD2O96028 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NSD2O96028 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NSD2O96028 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD2O96028 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD2O96028 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD2O96028 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD2O96028 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD2O96028 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NSD2O96028 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
NSD2O96028 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms