Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX7O95931 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX7O95931 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX7O95931 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX7O95931 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX7O95931 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX7O95931 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX7O95931 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX7O95931 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX7O95931 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CBX7O95931 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBX7O95931 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX7O95931 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX7O95931 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX7O95931 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX7O95931 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX7O95931 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX7O95931 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX7O95931 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX7O95931 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX7O95931 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX7O95931 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX7O95931 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX7O95931 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX7O95931 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX7O95931 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX7O95931 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX7O95931 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX7O95931 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX7O95931 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX7O95931 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX7O95931 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX7O95931 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX7O95931 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX7O95931 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX7O95931 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CBX7O95931 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX7O95931 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX7O95931 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX7O95931 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX7O95931 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX7O95931 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX7O95931 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX7O95931 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX7O95931 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX7O95931 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX7O95931 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX7O95931 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX7O95931 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX7O95931 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX7O95931 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX7O95931 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX7O95931 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX7O95931 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX7O95931 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX7O95931 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms