Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4FO95754 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4FO95754 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms