Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF12O95522 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF12O95522 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms