Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRPM2O94759 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRPM2O94759 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRPM2O94759 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms