Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK2AP2O75956 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK2AP2O75956 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms