Protein–RNA interactions for Protein: O75838

CIB2, Calcium and integrin-binding family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2O75838 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB2O75838 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB2O75838 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB2O75838 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB2O75838 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB2O75838 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB2O75838 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIB2O75838 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB2O75838 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIB2O75838 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB2O75838 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB2O75838 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB2O75838 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIB2O75838 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB2O75838 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB2O75838 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB2O75838 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB2O75838 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB2O75838 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB2O75838 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB2O75838 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB2O75838 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIB2O75838 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB2O75838 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB2O75838 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB2O75838 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB2O75838 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB2O75838 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB2O75838 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIB2O75838 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB2O75838 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB2O75838 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB2O75838 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB2O75838 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB2O75838 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB2O75838 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB2O75838 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIB2O75838 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB2O75838 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB2O75838 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB2O75838 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB2O75838 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB2O75838 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB2O75838 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB2O75838 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB2O75838 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIB2O75838 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CIB2O75838 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CIB2O75838 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB2O75838 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB2O75838 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB2O75838 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB2O75838 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIB2O75838 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB2O75838 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB2O75838 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB2O75838 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB2O75838 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB2O75838 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB2O75838 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB2O75838 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB2O75838 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIB2O75838 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB2O75838 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB2O75838 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB2O75838 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB2O75838 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB2O75838 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB2O75838 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIB2O75838 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB2O75838 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB2O75838 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB2O75838 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB2O75838 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB2O75838 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB2O75838 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB2O75838 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIB2O75838 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB2O75838 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB2O75838 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB2O75838 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB2O75838 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB2O75838 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB2O75838 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB2O75838 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIB2O75838 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CIB2O75838 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CIB2O75838 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CIB2O75838 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CIB2O75838 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms