Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KATNA1O75449 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KATNA1O75449 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNA1O75449 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms