Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT3O75175 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms