Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBNO60934 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBNO60934 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBNO60934 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBNO60934 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBNO60934 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBNO60934 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NBNO60934 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBNO60934 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBNO60934 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBNO60934 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBNO60934 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBNO60934 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBNO60934 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBNO60934 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBNO60934 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBNO60934 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBNO60934 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBNO60934 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBNO60934 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NBNO60934 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBNO60934 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NBNO60934 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBNO60934 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBNO60934 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBNO60934 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBNO60934 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBNO60934 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NBNO60934 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBNO60934 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NBNO60934 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBNO60934 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBNO60934 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBNO60934 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBNO60934 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBNO60934 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBNO60934 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NBNO60934 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBNO60934 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBNO60934 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBNO60934 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBNO60934 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBNO60934 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBNO60934 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NBNO60934 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBNO60934 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBNO60934 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBNO60934 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NBNO60934 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NBNO60934 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBNO60934 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBNO60934 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBNO60934 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NBNO60934 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NBNO60934 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NBNO60934 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBNO60934 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBNO60934 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBNO60934 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBNO60934 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NBNO60934 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBNO60934 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBNO60934 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBNO60934 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBNO60934 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NBNO60934 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBNO60934 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NBNO60934 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NBNO60934 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBNO60934 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBNO60934 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBNO60934 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NBNO60934 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBNO60934 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NBNO60934 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NBNO60934 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBNO60934 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBNO60934 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NBNO60934 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBNO60934 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBNO60934 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBNO60934 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBNO60934 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBNO60934 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBNO60934 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBNO60934 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBNO60934 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBNO60934 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBNO60934 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBNO60934 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms