Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
REV3LO60673 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REV3LO60673 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REV3LO60673 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REV3LO60673 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
REV3LO60673 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REV3LO60673 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
REV3LO60673 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REV3LO60673 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REV3LO60673 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REV3LO60673 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REV3LO60673 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REV3LO60673 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
REV3LO60673 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
REV3LO60673 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
REV3LO60673 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
REV3LO60673 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
REV3LO60673 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
REV3LO60673 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
REV3LO60673 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
REV3LO60673 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
REV3LO60673 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REV3LO60673 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REV3LO60673 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
REV3LO60673 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
REV3LO60673 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REV3LO60673 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REV3LO60673 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REV3LO60673 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REV3LO60673 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REV3LO60673 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REV3LO60673 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REV3LO60673 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REV3LO60673 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REV3LO60673 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REV3LO60673 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REV3LO60673 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REV3LO60673 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REV3LO60673 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REV3LO60673 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REV3LO60673 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REV3LO60673 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REV3LO60673 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REV3LO60673 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
REV3LO60673 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REV3LO60673 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REV3LO60673 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REV3LO60673 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REV3LO60673 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REV3LO60673 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REV3LO60673 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REV3LO60673 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REV3LO60673 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REV3LO60673 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REV3LO60673 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REV3LO60673 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REV3LO60673 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
REV3LO60673 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
REV3LO60673 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REV3LO60673 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
REV3LO60673 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
REV3LO60673 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
REV3LO60673 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REV3LO60673 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
REV3LO60673 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
REV3LO60673 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
REV3LO60673 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
REV3LO60673 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
REV3LO60673 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REV3LO60673 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
REV3LO60673 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
REV3LO60673 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REV3LO60673 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REV3LO60673 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
REV3LO60673 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REV3LO60673 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REV3LO60673 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
REV3LO60673 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REV3LO60673 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REV3LO60673 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REV3LO60673 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REV3LO60673 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
REV3LO60673 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
REV3LO60673 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
REV3LO60673 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
REV3LO60673 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REV3LO60673 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
REV3LO60673 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REV3LO60673 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
REV3LO60673 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REV3LO60673 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
REV3LO60673 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
REV3LO60673 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REV3LO60673 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REV3LO60673 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REV3LO60673 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REV3LO60673 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REV3LO60673 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REV3LO60673 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REV3LO60673 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.6 ms