Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINK4O60575 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPINK4O60575 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1321.1 ms