Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFDO43915 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFDO43915 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms