Protein–RNA interactions for Protein: O43837

IDH3B, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3BO43837 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3BO43837 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3BO43837 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3BO43837 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3BO43837 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3BO43837 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IDH3BO43837 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3BO43837 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms