Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB2O43679 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB2O43679 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB2O43679 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB2O43679 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB2O43679 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB2O43679 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB2O43679 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB2O43679 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB2O43679 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB2O43679 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB2O43679 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB2O43679 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDB2O43679 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDB2O43679 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDB2O43679 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDB2O43679 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDB2O43679 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDB2O43679 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDB2O43679 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDB2O43679 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDB2O43679 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB2O43679 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB2O43679 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB2O43679 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB2O43679 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB2O43679 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB2O43679 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB2O43679 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB2O43679 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB2O43679 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB2O43679 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB2O43679 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB2O43679 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB2O43679 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB2O43679 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB2O43679 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB2O43679 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB2O43679 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB2O43679 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB2O43679 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB2O43679 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB2O43679 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB2O43679 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB2O43679 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB2O43679 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB2O43679 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB2O43679 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB2O43679 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB2O43679 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB2O43679 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB2O43679 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB2O43679 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB2O43679 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB2O43679 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB2O43679 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB2O43679 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB2O43679 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB2O43679 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB2O43679 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB2O43679 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB2O43679 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDB2O43679 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDB2O43679 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB2O43679 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB2O43679 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB2O43679 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB2O43679 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB2O43679 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB2O43679 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB2O43679 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB2O43679 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB2O43679 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB2O43679 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB2O43679 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB2O43679 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB2O43679 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB2O43679 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB2O43679 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB2O43679 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB2O43679 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB2O43679 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB2O43679 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB2O43679 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB2O43679 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB2O43679 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB2O43679 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB2O43679 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB2O43679 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms