Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF208O43345 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF208O43345 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZNF208O43345 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF208O43345 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF208O43345 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF208O43345 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF208O43345 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF208O43345 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF208O43345 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF208O43345 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF208O43345 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF208O43345 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF208O43345 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF208O43345 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF208O43345 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF208O43345 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF208O43345 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF208O43345 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF208O43345 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms