Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD3EAPO15446 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD3EAPO15446 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms