Protein–RNA interactions for Protein: O15067

PFAS, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFASO15067 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFASO15067 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFASO15067 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFASO15067 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFASO15067 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFASO15067 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFASO15067 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFASO15067 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFASO15067 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFASO15067 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFASO15067 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFASO15067 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PFASO15067 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFASO15067 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFASO15067 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFASO15067 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PFASO15067 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PFASO15067 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PFASO15067 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PFASO15067 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFASO15067 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFASO15067 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFASO15067 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFASO15067 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFASO15067 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFASO15067 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PFASO15067 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFASO15067 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFASO15067 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFASO15067 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFASO15067 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFASO15067 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFASO15067 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFASO15067 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFASO15067 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFASO15067 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFASO15067 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFASO15067 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFASO15067 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFASO15067 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFASO15067 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFASO15067 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFASO15067 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFASO15067 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFASO15067 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFASO15067 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFASO15067 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFASO15067 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFASO15067 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PFASO15067 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFASO15067 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PFASO15067 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFASO15067 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFASO15067 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFASO15067 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PFASO15067 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFASO15067 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFASO15067 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFASO15067 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFASO15067 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFASO15067 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFASO15067 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFASO15067 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PFASO15067 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFASO15067 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFASO15067 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFASO15067 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFASO15067 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFASO15067 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFASO15067 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFASO15067 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFASO15067 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFASO15067 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFASO15067 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFASO15067 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFASO15067 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFASO15067 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFASO15067 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFASO15067 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFASO15067 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFASO15067 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFASO15067 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PFASO15067 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFASO15067 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFASO15067 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFASO15067 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFASO15067 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFASO15067 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms