Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN9O14815 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN9O14815 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms