Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CUX2O14529 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CUX2O14529 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CUX2O14529 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CUX2O14529 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CUX2O14529 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CUX2O14529 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
CUX2O14529 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CUX2O14529 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
CUX2O14529 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
CUX2O14529 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
CUX2O14529 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CUX2O14529 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CUX2O14529 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CUX2O14529 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CUX2O14529 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CUX2O14529 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CUX2O14529 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CUX2O14529 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CUX2O14529 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CUX2O14529 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
CUX2O14529 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CUX2O14529 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CUX2O14529 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CUX2O14529 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CUX2O14529 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
CUX2O14529 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CUX2O14529 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CUX2O14529 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
CUX2O14529 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CUX2O14529 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CUX2O14529 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CUX2O14529 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CUX2O14529 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CUX2O14529 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CUX2O14529 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CUX2O14529 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CUX2O14529 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CUX2O14529 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CUX2O14529 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CUX2O14529 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CUX2O14529 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CUX2O14529 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CUX2O14529 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CUX2O14529 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CUX2O14529 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CUX2O14529 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CUX2O14529 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CUX2O14529 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
CUX2O14529 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CUX2O14529 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CUX2O14529 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CUX2O14529 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CUX2O14529 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CUX2O14529 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.19
CUX2O14529 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CUX2O14529 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CUX2O14529 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
CUX2O14529 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CUX2O14529 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CUX2O14529 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CUX2O14529 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CUX2O14529 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CUX2O14529 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CUX2O14529 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CUX2O14529 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CUX2O14529 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
CUX2O14529 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CUX2O14529 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CUX2O14529 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CUX2O14529 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CUX2O14529 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CUX2O14529 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CUX2O14529 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CUX2O14529 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CUX2O14529 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CUX2O14529 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CUX2O14529 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CUX2O14529 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CUX2O14529 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CUX2O14529 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CUX2O14529 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CUX2O14529 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CUX2O14529 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CUX2O14529 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CUX2O14529 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CUX2O14529 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CUX2O14529 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CUX2O14529 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CUX2O14529 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
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