Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRTO14522 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRTO14522 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
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