Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP6CO00743 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP6CO00743 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP6CO00743 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms