Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F3O00716 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F3O00716 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F3O00716 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F3O00716 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F3O00716 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F3O00716 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F3O00716 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F3O00716 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F3O00716 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F3O00716 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F3O00716 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F3O00716 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F3O00716 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F3O00716 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F3O00716 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F3O00716 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F3O00716 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F3O00716 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F3O00716 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F3O00716 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F3O00716 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F3O00716 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F3O00716 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F3O00716 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F3O00716 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F3O00716 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F3O00716 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F3O00716 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F3O00716 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F3O00716 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F3O00716 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F3O00716 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F3O00716 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F3O00716 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F3O00716 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F3O00716 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F3O00716 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F3O00716 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F3O00716 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F3O00716 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F3O00716 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F3O00716 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F3O00716 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F3O00716 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F3O00716 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F3O00716 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F3O00716 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F3O00716 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F3O00716 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F3O00716 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F3O00716 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F3O00716 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F3O00716 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F3O00716 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F3O00716 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F3O00716 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F3O00716 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F3O00716 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F3O00716 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F3O00716 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F3O00716 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F3O00716 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F3O00716 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F3O00716 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F3O00716 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F3O00716 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F3O00716 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F3O00716 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F3O00716 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F3O00716 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F3O00716 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F3O00716 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F3O00716 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F3O00716 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F3O00716 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F3O00716 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F3O00716 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F3O00716 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms