Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 RPS6KA4-205ENST00000530504 2114 ntTSL 520.69■□□□□ 0.93e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 RPS6KA4-206ENST00000531659 555 ntTSL 220.01■□□□□ 0.793e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 IFT57-202ENST00000465024 755 ntTSL 218.6■□□□□ 0.573e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 RPS6KA4-203ENST00000528355 2532 ntTSL 218.34■□□□□ 0.533e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 IFT57-206ENST00000492106 526 ntTSL 418.07■□□□□ 0.483e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 CTBS-204ENST00000477677 2892 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.352e-14■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 CLIC4-203ENST00000489758 439 ntTSL 216.99■□□□□ 0.311e-21■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.093e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 RPS6KA4-204ENST00000530383 521 ntTSL 215.35■□□□□ 0.053e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.033e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 WASHC2A-205ENST00000434114 3287 ntTSL 514.64□□□□□ -0.073e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.091e-21■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.159e-32■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 CLIC4-202ENST00000488683 2723 ntTSL 213.84□□□□□ -0.191e-21■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 IFT57-204ENST00000478157 931 ntTSL 513.61□□□□□ -0.233e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 WASHC2A-201ENST00000282633 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.33e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 LINC00689-202ENST00000417032 546 ntTSL 412.04□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 AP001171.1-201ENST00000436373 864 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -13e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 USP16-202ENST00000399973 581 ntTSL 38.62□□□□□ -1.033e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 PHF7-208ENST00000482327 576 ntTSL 28.38□□□□□ -1.073e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 CTBS-201ENST00000370625 1633 ntTSL 28.37□□□□□ -1.072e-14■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.153e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.243e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.342e-14■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.383e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 PYGO2-203ENST00000483463 594 ntTSL 25.17□□□□□ -1.589e-32■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 USP16-205ENST00000474835 3835 ntTSL 1 (best)4.43□□□□□ -1.73e-11■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 NDC80-204ENST00000575515 553 ntTSL 510.44□□□□□ -0.743e-9■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.263e-9■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.084e-13■■■■■ 50.3
DDX3XO00571 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -11e-7■■■■■ 50.3
DDX3XO00571 TTL-204ENST00000485537 1094 ntTSL 321.9■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 50.2
DDX3XO00571 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.841e-17■■■■■ 50.2
DDX3XO00571 SIVA1-204ENST00000553810 550 ntTSL 319.4■□□□□ 0.71e-17■■■■■ 50.2
DDX3XO00571 SIVA1-206ENST00000554013 461 ntTSL 1 (best)18.87■□□□□ 0.611e-17■■■■■ 50.2
DDX3XO00571 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.592e-7■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 FGD5-AS1-203ENST00000426200 1874 ntTSL 1 (best)22.9■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.797e-7■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.597e-7■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.475e-13■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.785e-13■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 IL1R1-211ENST00000442590 577 ntTSL 312.36□□□□□ -0.435e-13■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 IL1R1-209ENST00000428279 1525 ntTSL 511.38□□□□□ -0.595e-13■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 IL1R1-212ENST00000450319 549 ntTSL 311.37□□□□□ -0.595e-13■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 IL1R1-203ENST00000409589 3544 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.685e-13■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.975e-13■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.275e-13■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.435e-13■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 IL1R1-213ENST00000452403 609 ntTSL 35.97□□□□□ -1.455e-13■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 TSG101-206ENST00000542488 304 ntTSL 54.19□□□□□ -1.741e-12■■■■■ 50.1
DDX3XO00571 MUM1-208ENST00000590695 2290 ntTSL 527.82■■■□□ 2.045e-8■■■■■ 50
DDX3XO00571 MUM1-209ENST00000590866 1513 ntTSL 327.43■■□□□ 1.985e-8■■■■■ 50
DDX3XO00571 MUM1-215ENST00000592374 522 ntTSL 225.29■■□□□ 1.645e-8■■■■■ 50
DDX3XO00571 MUM1-210ENST00000591337 1018 ntTSL 224.1■■□□□ 1.455e-8■■■■■ 50
DDX3XO00571 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.666e-7■■■■■ 50
DDX3XO00571 MUM1-211ENST00000591433 2603 ntTSL 517.69■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 50
DDX3XO00571 MUM1-205ENST00000587460 2793 ntTSL 1 (best)16.79■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 50
DDX3XO00571 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 50
DDX3XO00571 MUM1-214ENST00000591806 4067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 50
DDX3XO00571 MUM1-206ENST00000588810 867 ntTSL 511.53□□□□□ -0.566e-7■■■■■ 50
DDX3XO00571 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC14.41□□□□□ -0.16e-19■■■■■ 50
DDX3XO00571 GPX4-202ENST00000585362 859 ntTSL 227■■□□□ 1.915e-28■■■■■ 50
DDX3XO00571 GPX4-211ENST00000614791 431 ntTSL 323.81■■□□□ 1.45e-28■■■■■ 50
DDX3XO00571 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 50
DDX3XO00571 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 50
DDX3XO00571 CENPM-207ENST00000460824 303 ntTSL 315.3■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 50
DDX3XO00571 CENPM-202ENST00000396437 689 ntTSL 311.55□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 50
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DDX3XO00571 IMPDH2-201ENST00000326739 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-84■■■■■ 49.9
DDX3XO00571 IMPDH2-210ENST00000485500 852 ntTSL 311.28□□□□□ -0.62e-84■■■■■ 49.9
DDX3XO00571 IMPDH2-203ENST00000442157 865 ntTSL 210.07□□□□□ -0.82e-84■■■■■ 49.9
DDX3XO00571 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.076e-8■■■■■ 49.8
DDX3XO00571 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.046e-8■■■■■ 49.8
DDX3XO00571 ATG9A-203ENST00000409033 3701 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 49.8
DDX3XO00571 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 49.8
DDX3XO00571 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.918e-15■■■■■ 49.8
DDX3XO00571 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.628e-15■■■■■ 49.8
DDX3XO00571 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.519e-15■■■■■ 49.8
DDX3XO00571 ISOC2-208ENST00000591718 786 ntTSL 217.77■□□□□ 0.448e-15■■■■■ 49.8
DDX3XO00571 ISOC2-205ENST00000589080 763 ntTSL 215.27■□□□□ 0.048e-15■■■■■ 49.8
DDX3XO00571 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.856e-59■■■■■ 49.8
DDX3XO00571 PHF5A-202ENST00000459687 504 ntTSL 36.37□□□□□ -1.394e-8■■■■■ 49.6
DDX3XO00571 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 49.5
DDX3XO00571 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.037e-8■■■■■ 49.5
DDX3XO00571 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.615e-12■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.475e-12■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.455e-12■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.445e-12■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.135e-12■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 SCP2-210ENST00000478631 5204 ntTSL 212.55□□□□□ -0.45e-12■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.678e-9■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 STX3-206ENST00000533637 1024 ntTSL 215.87■□□□□ 0.138e-9■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 08e-9■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.39□□□□□ -1.558e-9■■■■■ 49.4
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