Protein–RNA interactions for Protein: O00231

PSMD11, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD11O00231 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD11O00231 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD11O00231 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD11O00231 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms