Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGPSO00116 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGPSO00116 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGPSO00116 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGPSO00116 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGPSO00116 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGPSO00116 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGPSO00116 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGPSO00116 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGPSO00116 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGPSO00116 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGPSO00116 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGPSO00116 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGPSO00116 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGPSO00116 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGPSO00116 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGPSO00116 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGPSO00116 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGPSO00116 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGPSO00116 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGPSO00116 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGPSO00116 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGPSO00116 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGPSO00116 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGPSO00116 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPSO00116 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPSO00116 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPSO00116 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPSO00116 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPSO00116 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPSO00116 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPSO00116 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPSO00116 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGPSO00116 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPSO00116 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPSO00116 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPSO00116 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGPSO00116 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AGPSO00116 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AGPSO00116 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AGPSO00116 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGPSO00116 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPSO00116 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPSO00116 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPSO00116 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPSO00116 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPSO00116 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPSO00116 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPSO00116 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPSO00116 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPSO00116 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGPSO00116 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPSO00116 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGPSO00116 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AGPSO00116 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPSO00116 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPSO00116 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPSO00116 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPSO00116 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPSO00116 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGPSO00116 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPSO00116 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPSO00116 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPSO00116 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPSO00116 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPSO00116 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPSO00116 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGPSO00116 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGPSO00116 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGPSO00116 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGPSO00116 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGPSO00116 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGPSO00116 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGPSO00116 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPSO00116 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPSO00116 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPSO00116 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPSO00116 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms