Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVH48-1M5A8F1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVH48-1M5A8F1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms