Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms