Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC01387J3KSC0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC01387J3KSC0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC01387J3KSC0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms