Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF26H0Y7S4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF26H0Y7S4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms