Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF879B4DU55 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF879B4DU55 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms