Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOBPA7XYQ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOBPA7XYQ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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