Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC4A6NH21 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC4A6NH21 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC4A6NH21 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC4A6NH21 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC4A6NH21 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC4A6NH21 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC4A6NH21 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SERINC4A6NH21 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERINC4A6NH21 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms