Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WIPF3A6NGB9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WIPF3A6NGB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WIPF3A6NGB9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WIPF3A6NGB9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WIPF3A6NGB9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WIPF3A6NGB9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.32■■□□□ 1
WIPF3A6NGB9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
WIPF3A6NGB9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
WIPF3A6NGB9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.32■■□□□ 1
WIPF3A6NGB9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WIPF3A6NGB9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WIPF3A6NGB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms