Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C5orf60A6NFR6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C5orf60A6NFR6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms